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被污染的地下水通过多孔介质含水层的机械过滤，去除其中悬浮的污染物和细菌等，而使地下水得到净化的作用，是地下水的自然净化方式之一。
医疗废水中的病原微生物主要有：病原性细菌，肠道病毒、蠕虫卵和原虫四类。具体包括沙门氏菌属痢疾杆菌、霍乱弧菌、致病性大肠杆菌、传染性肝炎病毒、脊髓灰质炎病毒、柯萨基病毒、蛔虫卵、钩虫卵、血吸虫卵、阿米巴原虫。
